El Dr. José Antonio Paczka Z. se formó como oftalmólogo en uno de los hospitales de especialidad más sobresalientes de Latinoamérica. En ese mismo centro hospitalario realizó su especialidad en glaucoma durante dos años y posteriormente, obtuvo por oposición un puesto como especialista de base en el servicio de glaucoma. Durante un año más, profundizó sus conocimientos y destrezas profesionales en el Wilmer Eye Institute del Hospital Johns Hopkins en Baltimore, Maryland, E.U.A. Una vez regresando de su experiencia en los Estados Unidos se incorporó como académico de alto perfil a la Universidad de Guadalajara, formando parte como co-fundador del Instituto de Investigación de Oftalmología y Ciencias Visuales de dicha universidad, en donde funge como profesor investigador titular.
El Dr. Paczka es director de Global Glaucoma Institute occidente, organización especializada en la detección y tratamiento médico-quirúrgico del glaucoma y de otros padecimientos oculares relevantes. También dirige el Instituto Glaucoma, asociación civil filantrópica para el manejo del glaucoma y otras enfermedades de los ojos en el occidente de México.
Además de sus actividades docentes y de investigación, el Dr. Paczka ha participado intensamente en la evaluación, desarrollo y aplicación de nuevas modalidades de tratamiento médico y quirúrgico del glaucoma y diversas condiciones que afectan los ojos. El Dr. Paczka ha sido presidente de la sociedad oftalmológica "Dr. Enrique Ávalos Pérez", de la Asociación Mexicana de Glaucoma y de la Asociación de Glaucoma de Occidente.
En su actividad académica ha sido conferencista en El Salvador, Costa Rica, Guatemala, Argentina, Chile, Perú, Ecuador, Panamá, Venezuela, Bolivia, Colombia, los Estados Unidos de América, Hong Kong, Uruguay, Finlandia y diversas ciudades en México. Es autor o co-autor de más de 20 artículos científicos originales y 8 capítulos de libro.
El Dr. José Antonio Paczka Z. mantiene vigente su membresía al Consejo Mexicano de Oftalmología, y es miembro de la Sociedad Mexicana de Oftalmología, el Colegio Mexicano de Glaucoma, la American Academy of Ophthalmology, la Sociedad Latinoamericana de Glaucoma, la Sociedad Panamericana de Glaucoma y la Association for Research in Vision and Ophthalmology, entre otras organizaciones profesionales internacionales.